2001
Entrée en vigueur de la «Convention commune sur la sûreté de la gestion du combustible usé et sur la sûreté des la gestion des déchets radioactifs» de l'AIEA.
Publication des rapports d'investigation du forage de Benken et de la Sismique-3D.
Participation au 5e Programme cadre de recherche de l’Union européenne.
2002
Acquisition d'une halle de stockage à Mellingen.
Le peuple du canton de Nidwald rejette, le 22 septembre, la concession accordée par le Conseil d'Etat pour une galerie de sondage au Wellenberg.
Dépôt au Conseil fédéral de la preuve de l'évacuation pour le projet «Argiles à Opalinus» (éléments combustibles usés, déchets de haute activité, déchets de faible et moyenne activité).
2003
Les deux initiatives populaires «Electricité sans atome» et «Moratoire plus» sont rejetées par le peuple en votation.
Le Conseil national et le Conseil des Etats adoptent une nouvelle loi sur l'énergie nucléaire.
Le Conseil national et le Conseil des Etats adoptent une nouvelle loi sur l'énergie nucléaire.
Liquidation de la Coopérative pour la gestion des déchets nucléaires au Wellenberg (GNW).
Réorganisation de la Nagra avec introduction d'une direction et d'un groupe de direction.
2004
Remise de l'expertise de la DSN sur l'option Socle cristallin.
Evaluation positive du rapport de sûreté sur «La démonstration de la faisabilité du stockage final des déchets radioactifs» par les experts de l'AEN/OCDE.
Le laboratoire souterrain du Grimsel (LSG) fête ses vingt ans d'existence.
Clôture du rapport de projet PEGASOS sur les aléas sismiques («PEGASOS-Erdbebengefährdungsstudie»).
2005
Entrée en vigueur de la nouvelle Loi sur l'énergie nucléaire (LENu) et de l'Ordonnance correspondante (OENu).
Le 14 juin, la Nagra est certifiée selon la norme ISO 90001:2000.
Création par le DETEC d'un Comité consultatif pour l'élaboration de la partie conceptuelle du Plan sectoriel.
Publication de l'expertise de la DSN et de la CGD (Commission de la gestion des déchets radioactifs) sur la démonstration de la faisabilité du stockage final. Edition publique: 3800 prises de position.
Publication de l'étude du Forum Opalinus sur les impacts sociaux-économiques d'une installation d'évacuation dans le Weinland zurichois.
Dépôt d'un rapport sur les options pour les déchets de haute activité.
2006
Le 28 juin, le conseil fédéral approuve la Démonstration de la faisabilité du stockage final pour les déchets de haute activité.

L’approbation de la Démonstration de la faisabilité du stockage final des déchets
radioactifs a mis un terme à un travail intensif sur des années, documenté par
de nombreux rapports techniques. (Photo: Comet)
Le Laboratoire souterrain du Mont Terri fête ses dix ans d'existence.
Le Conseil fédéral prend acte de l'étude sur les impacts sociaux-économiques des installations d'évacuation réalisée sur mandat de l'OFEN.
Actualisation de l'estimation des coûts pour les dépôts géologiques en profondeur.
Large procédure de participation sur l'ébauche du Plan sectoriel «Dépôts en couches géologiques profondes».
2007
Reprise de la vice-direction par Thomas Ernst.
Participation à divers forages de tiers pour l'amélioration des bases de données.
2008
Le 2 avril, le Conseil fédéral approuve le plan sectoriel «Dépôts en couches géologiques profondes». Commencement de l’étape 1 du plan sectoriel.
Le 6 novembre, l’OFEN publie les propositions de la Nagra sur les domaines d’implantation appropriés. Pour un dépôt pour DFMA: Südranden, Weinland zurichois, Nord des Lägeren, Bözberg, Pied sud du Jura et Wellenberg. Pour un dépôt DHA: Weinland zurichois, Nord des Lägeren, Bözberg.
Dans son rapport technique NTB 08-01, la Nagra publie le programme de gestion pour l’évacuation des déchets radioactifs en Suisse.