Les deux dépôts profonds doivent être construits là où la protection des gens et de l'environnement est la mieux assurée. La sécurité a la priorité sur toutes les autres considérations.
En se basant sur les exigences de la Confédération, la Nagra a proposé six régions envisageables. Pour les déchets de faible et de moyenne activité (DFMA), la construction d'un dépôt profond pourrait se faire dans les régions de Südranden (SH), Zurich nord-est (ZH/TG), Nord des Lägern (ZH/AG), Jura-est (AG), Pied sud du Jura (AG/SO) ou Wellenberg (NW/OW) (voirfigure). Dans les régions de Zurich nord-est, Nord des Lägern et Jura-est, on pourrait également établir un dépôt profond pour les déchets de haute activité (DHA), ou un dépôt pour les deux types de déchets. Les autorités de sécurité de la Confédération ont examiné les propositions de la Nagra pour les domaines d'implantation et les ont approuvées: le Conseil fédéral les a également approuvées.
Domaines d'implantation possibles d'un dépôt profond pour les déchets de haute activité (DHA) et d'un dépôt profond pour les déchets de faible et de moyenne activité (DFMA)